MSI MAG PANO M100R PZ сочетает стальной корпус с тремя стеклянными поверхностями: переход между стеклянной фронтальной и боковой панелями образован узкой и наклонной стеклянной поверхностью. MAG PANO M100R PZ является компактным вариантом и поэтому подходит только для материнских плат формата micro-ATX/ITX. Тем не менее, в корпусе найдется место для десяти вентиляторов или 360-мм радиатора под крышкой. MSI штатно оснащает корпус тремя реверсными 120-мм вентиляторами A-RGB сбоку и одним 120-мм вентилятором A-RGB на задней панели. Также предварительно установлен концентратор для четырех вентиляторов A-RGB.